В отдела работят трима уредника, между които са разпределени отговорностите за фонда и колекциите на музея. Един от уредниците в отдела завежда научния архив. Уредниците от отдел "Фондове" вземат участие в национални и регионални научни прояви, подготвят научни публикации, участват в експонирането на изложби в залите на музея и извън него. Вземат участие в културно образователни програми, предоставят справки и консултации.